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教員・学生・スタッフの紹介
藤本 明洋（Fujimoto, Akihiro）
（2016.4.1～2019.6.30）
昭和53年富山県生まれ。平成15年九州大学理学部生物学科卒業。平成20年東京大学医学系研究科修了。理化学研究所・次世代計算化学研究開発プログラム、理化学研究所・ゲノム医科学研究センター、理化学研究所・統合生命医科学研究センターを経て、現在、京都大学医学研究科特定准教授。
学部、修士課程では集団遺伝学を学び、博士課程では人類の表現型の違いに関わる遺伝子の検出とその進化の研究を行った。博士課程修了後、理化学研究所にて、次世代シークエンサーの情報解析を行い、日本人の全ゲノムシークエンスや肝臓がんの全ゲノムシークエンスを解析した。データ解析の方法論の開発と共に実験的研究を行うことで、医学研究に貢献したいと考えている。
- Fujimoto et al. (2008) A scan for genetic determinants of human hair morphology: EDAR is associated with Asian hair thickness. Hum Mol Genet 17: 835-843
- Fujimoto et al. (2010) Whole-genome sequencing and comprehensive variant analysis of a Japanese individual using massively parallel sequencing. Nat Genet 42: 931–936
- Fujimoto et al. (2012) Whole-genome sequencing of liver cancers identifies etiological influences on mutation patterns and recurrent mutations in chromatin regulators. Nat Genet 44: 760-76
- Shigemizu et al. (2013) A practical method to detect SNVs and indels from whole genome and exome sequencing data. Sci Rep 3: 2161
- Fujimoto et al. (2015) Whole-genome mutational landscape of liver cancers displaying biliary phenotype reveals hepatitis impact and molecular diversity. Nat Comms 6, Article number: 6120
- Fujimoto et al. (2016) Whole genome mutational landscape and characterization of non-coding and structural mutations in liver cancer. Nat Genet 48: 500-509
- Fujimoto et al. (2016) Systematic analysis of mutation distribution in three dimensional protein structures identifies cancer driver genes. Sci Rep 6, Article number: 26483